Markery nowotworowe to specyficzne substancje chemiczne o zróżnicowanej budowie (enzymy, białka, hormony) obecne we krwi, moczu bądź w wycinkach tkanek pacjenta. W zdrowych tkankach jest ich bardzo mało, kiedy pojawia się nowotwór, zaczyna się produkcja tych substancji. Badanie ich rodzaju oraz stężenia ułatwia postawienie diagnozy, ocenę ryzyka i długookresowe monitorowanie stanu zdrowia chorego. Markery nowotworowe mogą być wytwarzane zarówno bezpośrednio przez komórki guza jak i przez komórki zdrowe, które w ten sposób odpowiadają na przebiegający w organizmie proces patofizjologiczny. Ich znaczenie w leczeniu nowotworów różni się w zależności od tego, jaka substancja jest rozważana. Podstawowe zastosowania to:
- Określanie ryzyka (możliwość oszacowania indywidualnego prawdopodobieństwa rozwinięcia choroby nowotworowej).
- Badania przesiewowe (wykorzystanie w szeroko zakrojonych programach prewencji i wczesnego wykrywania raka).
- Diagnostyka różnicowa (specyficzność tkankowa substancji ułatwia identyfikację choroby).
- Przewidywanie skutków terapii (wykrycie potencjalnych celów terapeutycznych).
- Prognoza (określenie szansy na wyleczenie i szacowanej długości trwania życia).
- Monitoring stanu zdrowia pacjenta (nagłe skoki stężenia związków świadczą np. o postępach choroby lub ryzyku nawrotu).
Element Bioscience – System AVITI
Platforma do sekwencjonowania – AVITI™ – zapewnia najnowocześniejszą technologię sekwencjonowania, elastyczność i niezrównaną wydajność. Sekwencjonowanie odbywa się w technologii „ABC” – Avidity Base Chemistry, w którym proces amplifikacji zachodzi na zasadzie „toczącego koła” (ang. Rolling Circle Amplification – RCA). Dzięki temu replikacji poddawana jest jedynie oryginalna nić DNA, co redukuje ilość błędów, zachodzących podczas amplifikacji. Wykorzystując unikalną kombinację procesów enzymatycznych i chemicznych, ABC zwiększa specyficzność i czułość rozpoznawania zasad, co skutkuje wysoką wiernością danych sekwencjonowania przy minimalnych błędach.
System AVITI składa się z dwóch niezależnych komór, oferując 2 sekwenatory w jednym.
Sytem AVITI zapewnia:
- Oszczędność czasu i kosztów
- Technologia Dual Flow Cell – możliwość wykonania dwóch różnych, niezależnych badań, dzięki możliwości obsługi jednocześnie dwóch niezależnych od siebie flow celi z możliwością załadowania ich w różnym czasie (random acces)
- Dodatkowa funkcja Indywidualnie Adresowanych Linii (IAL) pozwala również na załadowanie 2 puli różnych bibliotek na jeden flow cell i odczyt danych z dwóch różnych linii.
- Nowe zestawy Trinity, skracające workflow pracy z bibliotekami panelowymi o 4-5h (https://www.elementbiosciences.com/trinity)
- Możliwość wyboru modelu „AVITI LT” o niższej cenie, dla aplikacji wymagających mniejszego outputu danych.
- Wiarygodne wyniki
- Dzięki technologii ABC, opartej na awidytach, która zwiększa specyficzność i czułość rozpoznawania zasad i redukuje ilość błędów. Dokładność odczytu Q30: >90% uzyskiwanych danych.
- Możliwość zwiększenia czułości poprzez zastosowanie nowej linii odczynników UltraQ (Q40: >90%; Q50: >70)
- Elastyczność
- Instrument kompatybilny z 3 rodzajami flow cell: niskoprzepustowe, średnioprzepustowe oraz wysokoprzepustowe.
- Zmienna długość odczytu 2×75 bp 2×150 bp 2x 300 bp.
- Instrument występuje również w wersji AVITI LT, która obsługuje flow celle low i medium output, z możliwością upgradu do pełnej wersji
- Oszczędność kosztów – innowacyjna technologia ABC, pozwoliła firmie Element znacznie zredukować koszty sekwencjonowania, poprzez eliminację chemii fluorescencyjnej stosowanej w przypadku znakowania każdej z zasad w technologii SBS oraz zredukowanie kosztów produkcji odczynników, co skutkuje znacznie niższym kosztem na próbkę.
- Szerokie możliwości badawcze – możliwość rozbudowy instrumentu o funkcje cytoprofilowania (AVITI 24 – NOWOŚĆ)
Testy qPCR – DIA CARTA
Najczęściej wykonywanymi testami w tym kierunku są mutacje związane z genami KRAS, BRAF, EGFR, PIK3CA, JAK2 czy NRAS.
Amerykańska firma DiaCarta w swoim portfolio posiada szereg testów w technologii qPCR do oznaczania mutacji związanych z chorobami nowotworowymi. Jest to linia testów QClamp.
- QClamp® EGFR Mutation Detection Test (CE IVD)
- QClamp® KRAS Mutation Detection Test (CE IVD)
- QClamp® BRAF Mutation Detection Test (CE IVD)
- QClamp® PIK3CA Mutation Detection Test (CE IVD)
- QClamp® JAK2 Mutation Detection Test (CE IVD)
- QClamp® NRAS Mutation Detection Test (wkrótce CE IVD!)
Powyższe produkty do wykrywania mutacji genowych QClamp® to wysoce czułe testy (z certyfikatem CE IVD) oparte na technologii qPCR do zastosowań z materiału klinicznego jakim jest: biopsja tkanek (FFPE) oraz biopsja płynna (ctDNA).
Testy QClamp® niezawodnie wykrywają od 0,1% do 0,5% zmutowanego DNA z DNA typu dzikiego pod kątem docelowych mutacji.
Dzięki tak szczegółowym informacjom można zastosować ukierunkowany schemat terapii przy użyciu podejścia medycyny spersonalizowanej. Doskonałym przykładem jest terapia celowana niedrobnokomórkowego raka płuca (NSCLC) wykorzystująca diagnostykę towarzyszącą w celu identyfikacji mutacji EGFR na różnych etapach terapii oraz stosowanie różnych leków z grupy inhibitorów tyrozyny w oparciu o specyficzną obecną mutację EGFR.
Testy QClamp® można przeprowadzić na standardowych urządzeniach qPCR w czasie rzeczywistym, takich jak ABI QuantStudio 5, Roche LightCycler® 480 i Bio-Rad CFX384 (w najbliższym czasie – około 1 miesiąca- ma pojawić się walidacja na Biorad CFX 96).
Nowa technologia XNA (xenonucleic acids) qPCR stworzona przez firmę DiaCarta to innowacyjne nowe oligomery molekularne kwasu nukleinowego, które hybrydyzują z docelowymi sekwencjami DNA i mogą być stosowane jako zaciski molekularne w ilościowych reakcjach łańcuchowych polimerazy w czasie rzeczywistym (qPCR). XNA ściśle wiąże się z sekwencją typu dzikiego, ale luźno z sekwencjami zmutowanymi, umożliwiając w ten sposób amplifikację zmutowanych sekwencji w reakcji PCR, jednocześnie blokując amplifikację sekwencji typu dzikiego. Dzięki powyższemu testy XNA clamp (testy „klamry” molekularnej) pozwalają na generowanie bardzo czułych wyników gdzie granica wykrywalności (LoD) może sięgać nawet 0,1% (7 lub 8 kopii zmutowanego DNA) przy użyciu 5 ng ctDNA, co odpowiada 2 ml krwi pacjenta.
IBL
Szeroki wybór testów ELISA pozwalający na rozpoznanie i różnicowanie guzów neuroendokrynnych: guza chromochłonnego, nauroblastomy czy ganglioneuromy:
- Metanephrine Urine ELISA
- Adrenalin ELISA (Epinephrine)
- Noradrenalin ELISA (Norepinephrine)
- Chromogranin A ELISA – wykazuje wysoką swoistość i czułość dla różnych guzów neuroendokrynnych (NET). Zastosowanie testu Chromogranin A ELISA firmy IBL gwarantuje: WIARYGODNOŚĆ BADAŃ – dzięki udowodnionej wysokiej czułości analitycznej testu: 1,4 ng/mL, wysokiej precyzji: <10% CV% oraz rozszerzonemu zakresowi analitycznemu do 2500 g/ml. JEDNOZNACZNE WYNIKI BADAŃ – zapewnione przez brak efektu Hook’a przy koncentracji badanego materiału nawet do 1 000 000 ng/ml. ZWIĘKSZENIE PRZEPUSTOWOŚCI LABORATORIUM poprzez AUTOMATYZACJĘ BADAŃ – możliwość automatyzacji wykonania badania oraz automatyzacji odczytu. MINIMALIZACJĘ ZUŻYCIA PRÓBKI – poprzez wykorzystanie jedynie 15 µL oraz kontrolę i bezpieczeństwo wykonania testu dzięki odczynnikom gotowym do użycia. OSZCZĘDNOŚĆ CZASU – zapewnioną poprzez brak konieczności rozcieńczania próbek oraz WYGODĘ I PROSTOTĘ WYKONANIA – dzięki przeprowadzaniu procesów inkubacji, bez użycia inkubatorów lub cieplarek, w temperaturze pokojowej.
- MetCombi Plasma ELISA (Metanephrine / Normetanephrine)
- CatCombi ELISA (Adrenalin/Epinephrine, Noradrenalin/Norepinephrine)
- CA 125 ELISA – marker raka jajnika
- CA 15-3 ELISA – marker raka piersi
- CA 19-9 ELISA – marker służący do monitorowania raka trzustki, żołądka, odbytnicy
- CA 242 ELISA – marker raka trzustki i odbytnicy
- CA 72-4 ELISA – monitorowanie raka przewodu pokarmowego, monitorowanie raka jajnika u pacjentek CA 125 negatywnych
- Free PSA ELISA, PSA ELISA , PSA Total ELISA – markery raka prostaty
- Calcitonin ELISA – marker raka rdzeniastego tarczycy
- CYFRA 21-1 ELISA –marker niedrobnokomórkowego raka płuc
- p53 ELISA – marker proliferacyjny (rak piersi, rak jelita grubego)
- CEA ELISA – marker raka jelita grubego
STRECK
Światowy producent probówek pobraniowych stabilizujących wolnokrążące kwasy nukleinowe oraz wolnokrążące komórki nowotworowe w płynach ustrojowych nawet do 14 dni od dnia pobrania próbki.
PROBÓWKI DO POBIERANIA KRWI Cell-Free DNA BCT® firmy Streck (USA)
Zabezpieczają wolno krążące DNA (cell free DNA) oraz stabilizują wolno krążące komórki nowotworowe (Circulating Tumor Cells) w osoczu krwi
ŚWIATOWY LIDER W STABILIZACJI KOMÓREK!!!
Kluczowym krokiem do podjęcia skutecznej terapii przeciwnowotworowej jest wczesne wykrycie metastazy oraz ciągłe monitorowanie stanu zdrowia pacjenta. Płynna biopsja niesie ze sobą nowe możliwości dla diagnostyki onkologicznej, a także naukowców pracujących nad innowacyjnymi terapiami. Płynna biopsja przede wszystkim umożliwia identyfikację komórek nowotworowych, których umiejscowienie w organizmie nie jest nam znane. Dodatkowym atutem jest bezinwazyjność tej metody w stosunku do klasycznej biopsji, która często niesie ze sobą niebezpieczeństwo dla zdrowia i życia pacjenta.
Płynna biopsja to tylko pierwszy krok w diagnostyce onkologicznej do otrzymania wyniku, który da pacjentowi szansę na dopasowanie skutecznej terapii przeciwnowotworowej. Dlatego też firma TK Biotech opracowała pełny workflow (proces diagnostyczny), który pozwala na przeprowadzenie całej procedury diagnostycznej – od pobrania krwi pacjenta, do analizy otrzymanych danych.
BIORON
§Wysokiej jakości testy real time PCR do oznaczania mutacji w genach: BRAF, EGFR, KRAS
FUJIREBIO
Szeroki wybór testów ELISA znajdujących zastosowanie w diagnostyce nowotworów